“对，还有你，海军部长韦尔斯先生，我要告诉你们，你们的权力都是人民给的。”约翰逊大概还想没完没了地讲下去，但哈姆林用胳膊肘子捅他，才让他打住了。

除了在场的目击者以外，别的人也都从报纸上读到副总统出洋相的情形。《纽约世界报》嘲笑约翰逊说：“连卡利古拉的马也比他懂事一些。”

事后，约翰逊羞愧难当，逃离首都，到一个朋友的农庄躲了两个星期。许多人以为他是藏起来继续酗酒，其实不然。只有林肯为他辩护：“我了解安迪已有多年。他那天是偶尔失态，但大家不必担心。安迪不是酒鬼。”事实上，那次就职典礼上，约翰逊是头一次露醉态，也是最后的一次。不幸的是，这仅有的一次酒后失控的时机可谓糟糕得没法更糟了。当他最后悄悄返回华盛顿时，总统有意避而不见。

当林肯1864年开始竞选连任时，他提名约翰逊做他的搭档，应该说是高明的一招。内战时，来自南方的参议员们都纷纷站到南方邦联一边，主张脱离联邦，这时只有约翰逊这一位来自南方的参议员坚决反对分裂合众国，疾言厉色谴责那些人威胁联邦的行径，他的言论经常上了报纸头版，他也就成为北方人心目中的英雄和政治明星。此后，约翰逊作为田纳西州军事长官，亲自指挥了该州首府纳什维尔的英勇保卫战，击退了叛军，严惩了俘获的邦联分子。

有几个人向林肯表示过反对意见。脾气暴躁的众议院领导人撒迪厄斯·史蒂文斯对林肯说：“难道你就找不出一个副总统候选人，为什么偏要从那些该死的造反省分挑出这么一个人？”但党内多数领导人赞成挑选约翰逊，当然只是作为配角，而不是作为当家人。约翰逊在就职典礼上的出洋相，让他们也怀疑自己是不是犯了一个严重错误。

仅仅六个星期之后，到了1865年4月14日，林肯总统在福特剧院被约翰·威尔克斯·布思刺杀。这时，人们对于副总统的嘀嘀咕咕一下子爆发成一片惊慌。约翰逊一向不爱看戏，认为那是“无聊”，所以出事的那天晚上正在旅馆睡觉。跟他住在一起的前威斯康星州长伦纳尔·法韦尔在剧场目击了那一惨剧，跑回来叫醒了约翰逊，让副总统惊悉了这一消息。

当人们获悉国务卿西沃德也被捅了一刀的消息时，就更加惊慌了。保安当局立即派来卫队保护副总统，因为当时不清楚阴谋的暗杀对象有多广。他们还不知道布思的一名同谋犯乔治·阿泽罗德特那天上午已经住进约翰逊所在的旅馆房间的楼上一间房内，打算晚上对约翰逊下毒手。晚上，他还找旅馆侍者细细盘问过副总统的动静，可是到了他们约定的下手时间，即晚上10点15分，正像他的律师后来所说的那样，“阿泽罗德特喝得酒醉如泥了”。

正当约翰逊刚刚惊醒过来想知道发生了什么事情的时候，他的私人秘书布朗宁告诉他在门口信箱里发现过一个字条：不想打搅了。你在家吗？

据旅馆侍者说，布思是那天下午来，打听副总统及其秘书在不在，然后留下了这一字条。布朗宁曾错误地以为布思这字条是留给他的，因为他在纳什维尔时就见过布思这名演员，如今才知道此人是刺客。这字条藏有恶毒用心，让人以为布思与约翰逊是相识的，但它也进一步证明了副总统是差一点儿被人下毒手。这时奄奄一息的林肯已被人抬到剧院对面的彼得森大厦，约翰逊赶紧去那里看望了垂死的总统。约翰逊小心谨慎，没在那里停留太久，也丝毫没有显出幸灾乐祸的样子。

翌日上午7时22分，林肯去世了。内阁立即通知了约翰逊。几小时后，约翰逊在他下榻的旅馆于肃穆气氛中宣誓继任总统。他的讲话非常简短又非常谦逊，说“刚刚发生的悲惨事件令我深感震惊而几乎难以自持”。他接着说：“如此重大的责任出人意外地压到我身上，使我感到力不胜任。”他的话缺乏令人鼓舞的力量，但这位新的首席行政长官表示决心竭尽全力承担总统职责，这也让观察家们稍感欣慰。