2009年，国务院批复同意建设中关村国家自主创新示范区，2010年国务院又出台了关于中关村“1+6”的政策和规划纲要，中关村的发展迈向体制机制改革和创新的深化发展阶段。近30年来，中关村从过去的“北京新技术产业开发试验区”到“国家自主创新示范区”，不断探索中国特色科技园区创新道路，成为国家高新区体制改革的领头羊。园区创业从自发到自主，从小型企业为主到大规模产业研发和生产为主，创造了若干奇迹和举世瞩目的骄人业绩。在中关村向更高层面迈进的过程中，体制障碍成为制约进一步发展的重要因素：园区管理的行政主体不明确，决策机制多元，影响了园区竞争力；空间区域关系复杂，导致多头管理，多方面牵制；区内外新旧管理体制矛盾冲突，产业链尚未形成有机联系；园区内资源、资金尚未有效整合，整体的品牌优势和国际产品创新优势不突出等。

　　借鉴国内外开发区和科技园管理体制的先进经验，结合中关村实际，就中关村体制机制再创新的途径建议如下：

　　第一、突出重点，在一区十园总格局不变的基础上，进行局部土地资源与行政主体的新整合，创立中关村示范区的核心区。要克服行政多头管理和空间资源零散等问题，进行跨行政区的资源整合，将“未来科技城”和“中关村科学城”所在的海淀区和昌平南部平原地区组建为新的行政区域，并对行政管理体系进行改造和类似“政策特区”式的建设，不新占用土地，不进行大规模建设，整合中央和北京市及原“两区”资源，通过优化整合和体制机制创新，以政府为主线，科研机构、高校、金融机构及各级各类企业参与，率先实现“深化改革先行区，开放创新引领区，高端要素聚合区，创新创业集聚地，战略产业策源地”的战略定位。

　　第二、成立统一的跨行政区开发建设领导机构，建立中关村示范区核心区新的行政管理体系。建议将原中关村科技园区管委会与核心区新的行政机构合并，形成“一园带十园”的总体格局，并在原来十园的基础上建立中关村创新大联盟。在核心区新的行政区划内，组建“双层行政模式”，原城区管理机构，主要行使社会管理职能；功能区管理机构，主要行使经济发展职能，赋予其更大的自主创新权，实现政企分开和政事分开，避免职能交叉。

　　第三、在核心区的功能区管理机构内，参照“蛇口模式”实行企业化管理。在功能区内外建立政府主导的基金会和以企业为主体的行业协会，以行业协会的形式帮助园内外企业沟通，促进行业自律、自检、自约束，解决行业问题和进行产业咨询等。政府通过法律、经济手段定制度，创环境，提供公共服务，维护市场秩序，引导创新活动方向，激励各创新主体之间的协同工作，实现灵活和富有活力的创新型园区管理机制。

　　第四、建立科技成果转化和产业化路线图，积极串接“一区十园”中的各园和各创新主体，创立创新大联盟，实现资源整合，创新成果提升。创新路线图将把中央、北京市和各区县的领导力、服务能力和资源效益整合起来，把各类型创新主体联合起来，把“一园带十园”的新体制搞活以促进创新平台的真正实现和不断提升。把中关村十园做成有机联系的大联盟，培育具有全球影响力的“创新桥”或“创新链”，使中关村国家自主创新示范区真正成为具有世界影响力的创新中心。